Parte del materiale che costituisce le tre sezioni, quella locale, quella generale e quella di conservazione, è rappresentato da alcuni fondi librari, quali:
Fondo Andrea Mascagni Fondo Tullio De Marchi Fondo Giuseppe Appiani Fondo Giancarlo Ansaloni Fondo Centro di Cultura dell'Alto Adige Fondo A.N.P.I. Fondo Latmag ediz. di Franco Latino e Franco Maria Maggi Fondo Lidia Menapace Fondo Centro Studi Atesini Fondo Cesare Guglielmo Fondo Luigi Serravalli Fondo Marco Giacomelli Fondo Fogolar Furlan
Fondo Associazione Scrittori Altoatesini (ASA)
Fondo Istituto degli Studi per l'Alto Adige - Firenze
Il materiale appartenente a questi fondi è contrassegnato da un'apposita etichetta interna.